Природні органічні пігменти отримують з рослинних або тваринних екстрактів. Вони є оригінальними версіями деяких відомих кольорів, але менш довговічні. Наприклад, тан виготовляли з чорнильних мішків молюсків, а кошеніль добували з комах кошеніль. Індійський жовтий, індиго та темно-зелений спочатку були отримані з рослин, і справжня марена троянди залишається такою. Чорний колір слонової кістки, чорний чорний і виноградний чорний виготовляють із деревного вугілля, виготовленого з обвугленої слонової кістки, кістки та деяких видів деревини.
До 1850-х років більшість органічних пігментів були природними, але з розвитком органічної хімії переважну більшість було замінено синтетичними органічними пігментами, деякі з яких імітують відтінки природної органіки. Фізичну форму та відтінок синтетичних пігментів легше контролювати, ніж природних пігментів, і вони, як правило, більш світлостійкі та пропонують ширший діапазон кольорів. Сучасні синтетичні органічні пігменти включають яскраві стійкі фталоціаніни, хінакридони та перилен.
Пофарбовані органічні пігменти включають фталоціанін, алізариновий малиновий, антрахіноновий червоний (більш світлостійка альтернатива алізарину), берлінський блакитний, жовтий Ганза, зелений Гукера, індиго, сірий Пейна, періноновий оранжевий і хінакридон (також має властивості прозорості). Незважаючи на те, що розмір частинок пігменту зазвичай відносно однорідний, все ще присутні деякі осадові органічні речовини, такі як ультрамарин синій, ультрамарин фіолетовий і блакитний. До прозорих органічних пігментів належать Rose Madder Genuine, Viridian і Quinacridones, які створюють чудову глазур.