Люмінесцентні барвники є незамінними і важливими інструментами в наукових дослідженнях, таких як клітинна біологія. Флуоресцентні кольорові фільтри є життєво важливим компонентом у мікроскопії флуоресцентності. Коли ми всі працюємо яскравістю люмінесцентних барвників, ми можемо порівняти яскравість флуоресцентних барвників за наведеним вище способом порівняння, так як порівняти яскравість загальних люмінесцентних барвників?
Яскравість флуоресцентного барвника може бути використана для порівняння ефектів флуоресцентного маркування різних флуоресцентних барвників, і виражається взаємозв'язком флуоресцентних сигналів негативної клітинної групи і позитивної клітинної групи. Однак флуоресцентний сигнал негативного населення клітин пов'язаний з багатьма факторами, такими як інтенсивність сигналу, автофлуоресценція, неспецифічне фарбування та електронний шум приладу.
Індекс флуоресцентного фарбування становить половину співвідношення між середньою інтенсивністю флуоресцентності позитивного популяції клітин і середньою інтенсивністю флуоресцентності негативного популяції клітин і стандартним відхиленням флуоресцентної інтенсивності негативного населення клітин. Коефіцієнт флуоресцентного фарбування пов'язаний тільки з такими факторами, як клонування антитіл і якість, флуоофорна чистота і якість, коефіцієнт модифікації флуоресцентності, лазерна лінія та її потужність, фільтри тривалого проходу та смуги пропуску, а також цільові клітини.
Фарбування індексу флуоресцентного барвника позитивно співвідноситься з яскравістю флуоресцентного барвника, тобто чим вище яскравість флуоресцентного барвника, тим вище коефіцієнт фарбування.